金年会自成立之初，就坚持对标国际最高水平，依照欧盟质量标准开展质量研究和工艺生产，目前已建立有一套符合国际质量标准的质量管理体系，覆盖从项目研发到物料管理、产品生产、质量控制、产品供应链管理以及产品上市后跟踪的全生命周期，为公司产品在多个国家及地区的商业化奠定扎实基础。
徐汇基地及配套的质量管理体系已通过多项由中国国家药监局、欧洲药品管理局、欧盟质量受权人以及国际商业合作伙伴（如Accord及Cipla）进行的实地核查及审计，获得中国和欧盟GMP认证；松江基地（一）已于2021年获得《药品生产许可证》，于2022年获中国GMP认证和欧盟QP认证，同步计划于2023年上半年完成FDA GMP核查；正在建设的松江基地（二）也正严格按照国际GMP标准设计，充分应用连续化生产技术等国际新技术，满足生物医药自动化、信息化、智能化国际水平（医药工业4.0）。
在富有国际工作经验的管理团队的带领下，金年会持续优化改进质量体系，改善质量运营效率，奠定了持续改进、不断完善的质量文化。